Нынешний Гулистанский государственный университет был основан на базе Сырдарьинского государственного педагогического института (SDPI), который начал свою работу впервые в 1965 году. В древнем поселении Мирзачуль были есть узбекские, казахские, русские и таджикские школы, где отсутствували  учителя с высшим образованием, что способствовало открытию высшего учебного заведения в области. В первый год были зачислены 400 студентов  на один факультет (филология).  В зависимости от потребности в персонале факультет открыл кафедры узбекского, русского, казахского  и иностранных языков. В начале года насчитывалось 30 преподавателей (из них  5 кандидатов наук).

В первом десятилетии была создана основа института и открыты новые факультеты: математика, физика, физическая культура, заочные отделения, библиотечное дело, начальное образование, история. До 1976 года институт подготовил 3200 специалистов для системы народного образования. Число преподавателей с ученой степенью выросло от 5 до 39 человек . Анкобой Кульжонов, Худойберди Дониёров защитили докторские диссертации в институте.

 Во втором десятилетии основное внимание  уделялось использованию на занятиях  технических средств обучения. В частности, внедрение телепередач, обучение через технические средства, вступительные экзамены на телешоу и практика сдачи государственных экзаменов вызвали большой интерес не только в республике, но и в бывшем Советском Союзе. Дополнительно были открыты  факультеты педагогики, истории и начального образования. Научный потенциал также вырос:защитили 1 докторскую и 25 кандидатских диссертаций.

 Третье десятилетие запомнилось в Гулистане тем, что было завершено строительство нынешнего здания университета . Яркие и удобные учебные кабинеты, оснащенные современным оборудованием, лабораториями и мебелью.